微机保护装置的程序主要有主程序和中断服务程序两大部分组成。

正常运行程序中进行采样值自动零漂调整、及运行状态检查，运行状态检查包括交流电压断线、检查开关位置状态、变化星制动电压形成、重合闸充电、准备手合判别等。不正常时发告警信号，信号分两种，一种是运行异常告警，这时不闭锁装置,提醒运行人员进行相应处理，另一种为闭锁告警信号，告警同时将装置闭锁，保护退出。

故障计算程序中进行各种保护的算法计算，跳闸逻辑判断以及事件报告、故障报告及波形的整理等。

主程序 按固定的采样周期接受采样中断进入采样程序，在采样程序中进行模拟星采集与滤波，开关量的采集、装置硬件自检、交流电流断线和起动判据的计算，根据是否满足起动条件而进入正常运行程序或故障计算程序。硬件自检内容包括RAM、E2PROM、 跳闸出口三极管等。

中断服务程序 中有正常运行程序模快和故障处理程序模块。

1、正常运行程序——包括开关位置检查、交流电压电流断线判断、交流回路零点调整等。

2、故障处理程序——根据被保护设备的不同，保护的故障处理程序有所不同。对于线路保护来说，一般包括纵联保护、距离保护、零序保护、电压电流保护等处理程序。

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